權能區分制度源於國父在民權主義第五講以及第六講之演講，相較於之前國父的五權憲法說，有更加具體突破。其主要突破背景是由於當時民國初年，北洋政府不尊重國會的存在，國會只是變成鞏固從袁世凱開始歷任總統權力來源的馬前卒，沒有向西方政治制度一樣發展出一套以國會為中心的政治制度。但是西方政治制度上，國會有民主性，因為有民主性所以才有立法權，制定法律，由人民來統治人民。但是西方民主政治運作情況下，國會議員沒有立法知識，動則使用質詢權以及預算權去卡住行政權，表面上是為了制衡，實際上是為了議員的政黨利益，所以才產生了權能區分理論。
權能區分理論就是人民有權，政府有能。人民有權，源於國民主權原理，國民是國家的主人，國民可以透過選舉、罷免、創制、複決權去決定國家走向，政府就是由五權間合作分工。而在地方上由人民直接行使，在中央由於中國地廣人眾，所以委由國民大會行使，所以國民大會為中央最高民意機關，但是在立法權上就是由政府中的立法院實行，所以立法院從性質上以及功能上，應該由各領域、各人民團體以及立法專家組成，但要對國民大會負責，國民大會可以透過創制以及複決權，向立法院展示其立法動向。
